Ngọc Điệm Thu lấy khung cảnh đầu thế kỷ 20, ở giữa thời loạn lạc ở Nam Hoài. Nữ sinh nghèo Diệp Bình Quân vô tình vướng vào một vụ ám sát cùng với chạm trán gỡ Ngu Sưởng Hiên, ngũ thiếu gia nhà bọn họ Ngu. Sau giai đoạn đầu đầy toan tính cùng nghi kỵ, cả hai dần nảy sinh tình cảm sâu đậm. Bên cạnh đó, song rồi hàng loạt biến cố cùng bi kịch đẩy Bình Quân đến nơi bờ vực tuyệt vời vọng, khiến cô bắt buộc phải rời xa Sưởng Hiên. Kinh qua đông đảo năm đau lòng cùng với dằn vặt, bọn họ chạm trán lại nhau, từng bước hóa giải thấu hiểu lầm và đối mặt với loạt bí ẩn trong thời đã qua.